Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMKR1H3BMG3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMKR1H3BMG3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms