Protein–RNA interactions for Protein: A6NIX2

WTIP, Wilms tumor protein 1-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WTIPA6NIX2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WTIPA6NIX2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WTIPA6NIX2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WTIPA6NIX2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WTIPA6NIX2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WTIPA6NIX2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WTIPA6NIX2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WTIPA6NIX2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WTIPA6NIX2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WTIPA6NIX2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WTIPA6NIX2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WTIPA6NIX2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
WTIPA6NIX2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
WTIPA6NIX2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
WTIPA6NIX2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
WTIPA6NIX2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
WTIPA6NIX2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
WTIPA6NIX2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
WTIPA6NIX2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
WTIPA6NIX2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WTIPA6NIX2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WTIPA6NIX2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WTIPA6NIX2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WTIPA6NIX2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WTIPA6NIX2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
WTIPA6NIX2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
WTIPA6NIX2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
WTIPA6NIX2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
WTIPA6NIX2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WTIPA6NIX2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WTIPA6NIX2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WTIPA6NIX2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WTIPA6NIX2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WTIPA6NIX2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms