Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1LA6NFU8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1LA6NFU8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms