Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms