Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms