Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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TCRBV5S1A1TA0A578 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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TCRBV5S1A1TA0A578 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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TCRBV5S1A1TA0A578 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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TCRBV5S1A1TA0A578 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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