Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 FHDC1-201ENST00000260008 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 UBA3-203ENST00000415609 2004 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 PCDHB11-201ENST00000354757 4198 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 RABL2A-207ENST00000409875 2282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 LILRB4-202ENST00000391733 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 SIGLEC6-206ENST00000436458 1713 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 MRVI1-215ENST00000541483 2468 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 CACNA1G-204ENST00000359106 7648 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 KIR2DL4-205ENST00000396284 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 ASPH-205ENST00000445642 3717 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 COX6B2-205ENST00000588572 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 TPT1-212ENST00000530705 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 ACBD5-205ENST00000396271 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 HIVEP1-209ENST00000627968 8924 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 HIPK1-AS1-204ENST00000450706 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 CEP41-201ENST00000223208 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 SLIT2-202ENST00000503823 5233 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 SV2C-201ENST00000322285 3010 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 CA6-203ENST00000377443 1319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SCN2BO60939 TSTA3-210ENST00000529064 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 TSEN2-204ENST00000415684 2279 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 EEF2KMT-202ENST00000458008 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SCN2BO60939 CTLA4-202ENST00000302823 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 LMO7DN-201ENST00000318245 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SCN2BO60939 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SCN2BO60939 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SCN2BO60939 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SCN2BO60939 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 RFC5-201ENST00000392542 2449 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 TBC1D8-201ENST00000376840 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 KIAA1024L-201ENST00000564719 2354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 VPS33B-201ENST00000333371 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 SLC38A1-206ENST00000549049 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 AP000821.1-201ENST00000567082 1909 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 OSBPL7-202ENST00000392507 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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