Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 TRIAP1-202ENST00000546954 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 LINC00963-216ENST00000623185 786 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 MTHFD2-202ENST00000409601 1865 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 LAMB3-202ENST00000367030 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 ACBD5-205ENST00000396271 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 FAM47A-202ENST00000613251 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 TK2-205ENST00000527284 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 ASB9-202ENST00000380485 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 SLC12A8-202ENST00000430155 2831 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 LIF-201ENST00000249075 3969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 HAND2-204ENST00000621866 1337 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 ACRBP-202ENST00000414226 1700 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 ALDH7A1-203ENST00000413020 1126 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC022239.3-201ENST00000528629 544 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AL158801.2-201ENST00000554650 554 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 MIR3610-201ENST00000582903 73 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AL627230.7-201ENST00000613971 601 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AL353626.2-201ENST00000615372 130 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 MIR124-2HG-203ENST00000521441 2840 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 CYTH2-213ENST00000620214 2020 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 CD1E-208ENST00000368163 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 OR2A9P-202ENST00000479102 1990 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 ASPH-205ENST00000445642 3717 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 RP2-201ENST00000218340 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 HIST1H1C-201ENST00000343677 642 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 MEOX1-203ENST00000393661 1206 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 LINC00189-201ENST00000420364 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 LDHAL6CP-201ENST00000502352 1142 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 ZNF175-203ENST00000545217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AC233702.8-201ENST00000579239 965 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AC093072.1-201ENST00000589196 602 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AC013403.2-201ENST00000607659 480 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 LINC00969-263ENST00000626007 839 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AL731555.1-201ENST00000634547 1259 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 HLA-DOB-206ENST00000438763 1372 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 HSPD1-201ENST00000345042 2299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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