Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
V9GYQ6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
V9GYQ6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
V9GYQ6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
V9GYQ6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
V9GYQ6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
V9GYQ6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
V9GYQ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
V9GYQ6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
V9GYQ6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
V9GYQ6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
V9GYQ6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
V9GYQ6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
V9GYQ6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
V9GYQ6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
V9GYQ6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
V9GYQ6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
V9GYQ6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
V9GYQ6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GYQ6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GYQ6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GYQ6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GYQ6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GYQ6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GYQ6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GYQ6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GYQ6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GYQ6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GYQ6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GYQ6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GYQ6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GYQ6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GYQ6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GYQ6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GYQ6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GYQ6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GYQ6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GYQ6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GYQ6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GYQ6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GYQ6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GYQ6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GYQ6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GYQ6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GYQ6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GYQ6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GYQ6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GYQ6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GYQ6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GYQ6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
V9GYQ6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
V9GYQ6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
V9GYQ6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
V9GYQ6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
V9GYQ6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GYQ6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GYQ6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GYQ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GYQ6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GYQ6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GYQ6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GYQ6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GYQ6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GYQ6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GYQ6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GYQ6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GYQ6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GYQ6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
V9GYQ6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
V9GYQ6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
V9GYQ6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
V9GYQ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
V9GYQ6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
V9GYQ6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
V9GYQ6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
V9GYQ6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
V9GYQ6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
V9GYQ6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
V9GYQ6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
V9GYQ6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
V9GYQ6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
V9GYQ6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
V9GYQ6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
V9GYQ6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
V9GYQ6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
V9GYQ6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
V9GYQ6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
V9GYQ6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
V9GYQ6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
V9GYQ6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
V9GYQ6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
V9GYQ6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
V9GYQ6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
V9GYQ6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
V9GYQ6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
V9GYQ6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
V9GYQ6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
V9GYQ6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
V9GYQ6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
V9GYQ6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms