Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms