Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms