Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms