Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNQ9P2M7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms