Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
MBD5Q9P267 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MBD5Q9P267 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MBD5Q9P267 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms