Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRMT1Q9NXH9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT1Q9NXH9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms