Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE7

PANK4, Pantothenate kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK4Q9NVE7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PANK4Q9NVE7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PANK4Q9NVE7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms