Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF275Q9NSD4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms