Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3GQ9NS98 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3GQ9NS98 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms