Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF4Q9NR80 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms