Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF2Q9HAU4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMURF2Q9HAU4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms