Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms