Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA6AQ9H2E6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA6AQ9H2E6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms