Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM6SF1Q9BZW5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM6SF1Q9BZW5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms