Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF8Q9BRL6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms