Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms