Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms