Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms