Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms