Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HOXB13Q92826 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB13Q92826 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB13Q92826 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB13Q92826 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB13Q92826 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB13Q92826 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB13Q92826 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB13Q92826 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB13Q92826 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB13Q92826 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB13Q92826 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB13Q92826 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms