Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf40Q8WUR7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms