Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPC24Q8NBT2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms