Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL2Q8N4E4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL2Q8N4E4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms