Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL34Q8N239 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL34Q8N239 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms