Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS37DQ86XT2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VPS37DQ86XT2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms