Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CFAP47Q6ZTR5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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