Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL54Q6P161 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL54Q6P161 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL54Q6P161 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL54Q6P161 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL54Q6P161 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL54Q6P161 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL54Q6P161 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL54Q6P161 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL54Q6P161 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL54Q6P161 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL54Q6P161 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL54Q6P161 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL54Q6P161 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms