Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms