Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIVEP3Q5T1R4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms