Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP221Q4G0U5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP221Q4G0U5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP221Q4G0U5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFAP221Q4G0U5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFAP221Q4G0U5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFAP221Q4G0U5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP221Q4G0U5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms