Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD55Q3KP44 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms