Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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