Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAM1Q15629 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms