Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SURF2Q15527 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SURF2Q15527 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SURF2Q15527 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SURF2Q15527 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SURF2Q15527 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SURF2Q15527 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SURF2Q15527 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SURF2Q15527 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SURF2Q15527 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SURF2Q15527 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SURF2Q15527 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms