Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 PLEKHH3-203ENST00000587627 1047 ntTSL 521.63■■□□□ 1.051e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.931e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.861e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.841e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.831e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.81e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.771e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.751e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 ACBD4-205ENST00000585553 2241 ntTSL 219.65■□□□□ 0.741e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.591e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 MAST1-203ENST00000588379 1408 ntTSL 1 (best)18.11■□□□□ 0.491e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 MIDN-204ENST00000590136 536 ntTSL 216.77■□□□□ 0.287e-9■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 SMARCAD1-207ENST00000510105 2409 ntTSL 516.45■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 NT5DC4-204ENST00000484666 416 ntTSL 514.05□□□□□ -0.161e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 NICN1-206ENST00000494057 645 ntTSL 213.84□□□□□ -0.195e-15■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 ACBD4-210ENST00000589752 804 ntTSL 313.76□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 PLXNB2-204ENST00000427829 567 ntTSL 413.71□□□□□ -0.215e-10■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 ACBD4-211ENST00000589798 494 ntTSL 513.41□□□□□ -0.261e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 TP53-220ENST00000610623 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.421e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 TP53-208ENST00000504290 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.421e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 ACBD4-213ENST00000591136 862 ntTSL 312.28□□□□□ -0.441e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 NICN1-202ENST00000422593 742 ntTSL 312.23□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 SF3B2-213ENST00000533421 407 ntTSL 311.86□□□□□ -0.511e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 TP53-223ENST00000618944 2404 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 TP53-213ENST00000510385 2404 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 STRIP1-209ENST00000540970 536 ntTSL 311.75□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 TP53-224ENST00000619186 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.581e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 TP53-209ENST00000504937 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.581e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 GRAMD4-206ENST00000456069 669 ntTSL 310.02□□□□□ -0.811e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 SIDT2-212ENST00000529441 1258 ntTSL 28.92□□□□□ -0.981e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 MAST1-205ENST00000590204 398 ntTSL 38.79□□□□□ -11e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 SGK1-216ENST00000489458 790 ntTSL 38.15□□□□□ -1.11e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 NICN1-205ENST00000461015 411 ntTSL 48.14□□□□□ -1.115e-15■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 SCAF4-205ENST00000472318 796 ntTSL 36.38□□□□□ -1.391e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 SGK1-217ENST00000490149 873 ntTSL 25.99□□□□□ -1.459e-9■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 SGK1-219ENST00000524764 498 ntTSL 24.76□□□□□ -1.657e-13■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 SF3B2-205ENST00000526653 329 ntTSL 24.75□□□□□ -1.651e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 SGK1-212ENST00000475882 615 ntTSL 34.44□□□□□ -1.79e-9■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 TP53-216ENST00000576024 175 ntTSL 1 (best)2.34□□□□□ -2.031e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 TBL1XR1-228ENST00000636864 6888 ntTSL 52.31□□□□□ -2.041e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 RPL14-205ENST00000461368 170 ntTSL 21.42□□□□□ -2.181e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 SLC25A10-206ENST00000573246 898 ntTSL 313.68□□□□□ -0.226e-9■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 EDC4-210ENST00000575507 570 ntTSL 213.4□□□□□ -0.269e-9■■■■■ 45.6
EFTUD2Q15029 EEF1A1-206ENST00000488500 792 ntTSL 27.2□□□□□ -1.263e-20■■■■■ 45.6
EFTUD2Q15029 SYNGAP1-212ENST00000636146 161 ntTSL 57.85□□□□□ -1.152e-10■■■■■ 45.6
EFTUD2Q15029 CNIH1-206ENST00000557659 856 ntTSL 211.04□□□□□ -0.646e-9■■■■■ 45.6
EFTUD2Q15029 CNIH1-204ENST00000554683 787 ntTSL 310.41□□□□□ -0.746e-9■■■■■ 45.6
EFTUD2Q15029 CNIH1-202ENST00000395573 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.776e-9■■■■■ 45.6
EFTUD2Q15029 CNIH1-207ENST00000557690 838 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.776e-9■■■■■ 45.6
EFTUD2Q15029 CNIH1-203ENST00000553660 785 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.86e-9■■■■■ 45.6
EFTUD2Q15029 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.326e-9■■■■■ 45.6
EFTUD2Q15029 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.366e-9■■■■■ 45.6
EFTUD2Q15029 TRAF4-213ENST00000578917 484 ntTSL 46.24□□□□□ -1.412e-16■■■■■ 45.6
EFTUD2Q15029 SLC1A5-204ENST00000593713 774 ntTSL 310.8□□□□□ -0.684e-12■■■■■ 45.6
EFTUD2Q15029 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 45.6
EFTUD2Q15029 MYNN-205ENST00000602751 2630 ntTSL 1 (best)5.07□□□□□ -1.63e-6■■■■■ 45.6
EFTUD2Q15029 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.73e-6■■■■■ 45.6
EFTUD2Q15029 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 45.5
EFTUD2Q15029 C1orf159-214ENST00000473600 793 ntTSL 316.14■□□□□ 0.176e-8■■■■■ 45.5
EFTUD2Q15029 C1orf159-206ENST00000427787 575 ntTSL 515.78■□□□□ 0.126e-8■■■■■ 45.5
EFTUD2Q15029 C1orf159-208ENST00000442117 554 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.81□□□□□ -0.046e-8■■■■■ 45.5
EFTUD2Q15029 EXOSC4-203ENST00000527954 1065 ntTSL 214.14□□□□□ -0.156e-8■■■■■ 45.5
EFTUD2Q15029 ADCY6-209ENST00000552099 1694 ntTSL 213.73□□□□□ -0.214e-7■■■■■ 45.5
EFTUD2Q15029 SLC25A10-208ENST00000574884 726 ntTSL 513.86□□□□□ -0.191e-8■■■■■ 45.5
EFTUD2Q15029 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.287e-7■■■■■ 45.4
EFTUD2Q15029 STRN4-219ENST00000600615 788 ntTSL 212.48□□□□□ -0.414e-7■■■■■ 45.4
EFTUD2Q15029 MYBBP1A-204ENST00000571354 579 ntTSL 322■■□□□ 1.112e-9■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 MAP2K3-205ENST00000477540 927 ntTSL 213.56□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.027e-77■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 SDCCAG3-210ENST00000481114 340 ntTSL 212.37□□□□□ -0.433e-11■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 P3H3-208ENST00000544813 573 ntTSL 515.22■□□□□ 0.034e-8■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 ILF3-223ENST00000593061 475 ntTSL 318.08■□□□□ 0.481e-8■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 STAT6-215ENST00000555222 2185 ntTSL 214.55□□□□□ -0.085e-13■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 STAT6-216ENST00000555318 465 ntTSL 36.64□□□□□ -1.355e-13■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 STAT6-210ENST00000554202 248 ntTSL 22.88□□□□□ -1.955e-13■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 ADSL-215ENST00000624503 754 ntTSL 519.45■□□□□ 0.74e-8■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 ADSL-204ENST00000466863 686 ntTSL 218.22■□□□□ 0.514e-8■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 MGAT4B-205ENST00000518778 1568 ntTSL 1 (best)21.65■■□□□ 1.067e-8■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 MGAT4B-209ENST00000519836 1686 ntTSL 1 (best)19.91■□□□□ 0.787e-8■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 MGAT4B-223ENST00000523382 778 ntTSL 310.51□□□□□ -0.737e-8■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 MGAT4B-207ENST00000518980 983 ntTSL 57.85□□□□□ -1.157e-8■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 RBM3-201ENST00000354480 1884 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.347e-14■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 MAP7D1-202ENST00000373148 1797 ntTSL 227.33■■□□□ 1.971e-6■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 MAP7D1-208ENST00000487114 890 ntTSL 224.61■■□□□ 1.531e-6■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 RPS16-206ENST00000601390 2389 ntTSL 211.47□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 RPS16-201ENST00000251453 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 RPS16-207ENST00000601655 492 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 RPS16-204ENST00000599539 555 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.185e-8■■■■■ 45.2
EFTUD2Q15029 C1orf35-203ENST00000469781 2256 ntTSL 221.99■■□□□ 1.115e-8■■■■■ 45.2
EFTUD2Q15029 C1orf35-205ENST00000485896 1429 ntTSL 220.02■□□□□ 0.85e-8■■■■■ 45.2
EFTUD2Q15029 C1orf35-204ENST00000472617 3554 ntTSL 214.9□□□□□ -0.025e-8■■■■■ 45.2
EFTUD2Q15029 ESYT1-204ENST00000548142 563 ntTSL 310.92□□□□□ -0.663e-10■■■■■ 45.2
EFTUD2Q15029 ARHGAP45-204ENST00000586033 545 ntTSL 518.99■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 45.2
EFTUD2Q15029 ARHGAP45-214ENST00000591293 645 ntTSL 317.98■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 45.2
EFTUD2Q15029 LASP1-209ENST00000585841 1408 ntTSL 216.8■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 45.2
EFTUD2Q15029 LASP1-205ENST00000443937 1482 ntTSL 1 (best)15.4■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 45.2
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