Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms