Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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