Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms