Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF4BQ13523 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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