Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP140Q13342 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP140Q13342 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP140Q13342 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP140Q13342 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SP140Q13342 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP140Q13342 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP140Q13342 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP140Q13342 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP140Q13342 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP140Q13342 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP140Q13342 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP140Q13342 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP140Q13342 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP140Q13342 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SP140Q13342 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SP140Q13342 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SP140Q13342 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SP140Q13342 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SP140Q13342 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
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SP140Q13342 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP140Q13342 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SP140Q13342 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP140Q13342 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP140Q13342 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP140Q13342 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP140Q13342 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP140Q13342 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SP140Q13342 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SP140Q13342 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP140Q13342 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP140Q13342 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP140Q13342 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP140Q13342 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SP140Q13342 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SP140Q13342 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SP140Q13342 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SP140Q13342 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SP140Q13342 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP140Q13342 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SP140Q13342 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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SP140Q13342 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP140Q13342 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP140Q13342 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP140Q13342 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP140Q13342 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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SP140Q13342 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SP140Q13342 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP140Q13342 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP140Q13342 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP140Q13342 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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SP140Q13342 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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SP140Q13342 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP140Q13342 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP140Q13342 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP140Q13342 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP140Q13342 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP140Q13342 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP140Q13342 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP140Q13342 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP140Q13342 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SP140Q13342 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP140Q13342 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP140Q13342 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP140Q13342 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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