Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.336e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.346e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 XPO6-214ENST00000569216 330 ntTSL 36.67□□□□□ -1.346e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 CCDC91-204ENST00000536154 549 ntTSL 46.66□□□□□ -1.346e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.356e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 KMT2C-206ENST00000424877 5874 ntTSL 56.6□□□□□ -1.356e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 CEP350-204ENST00000418229 992 ntTSL 56.58□□□□□ -1.366e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.376e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.416e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-229ENST00000529586 3203 ntTSL 1 (best)5.95□□□□□ -1.466e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-215ENST00000525514 3288 ntTSL 1 (best)5.9□□□□□ -1.466e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-233ENST00000531845 3230 ntTSL 25.88□□□□□ -1.476e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.476e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-222ENST00000528015 2201 ntTSL 1 (best)5.59□□□□□ -1.516e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-230ENST00000531519 2911 ntTSL 1 (best)5.54□□□□□ -1.526e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.536e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.536e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-208ENST00000438901 3481 ntTSL 1 (best)5□□□□□ -1.616e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 CCDC91-211ENST00000540794 518 ntTSL 35□□□□□ -1.616e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 FAM135A-204ENST00000393299 1780 ntTSL 24.88□□□□□ -1.636e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-220ENST00000526889 3157 ntTSL 1 (best)4.86□□□□□ -1.636e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 GCLM-203ENST00000467772 625 ntTSL 34.81□□□□□ -1.646e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 PUM3-204ENST00000490444 340 ntTSL 54.31□□□□□ -1.726e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 FAM135A-201ENST00000194672 5198 ntTSL 52.17□□□□□ -2.066e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.246e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.246e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 LRP5-206ENST00000529993 5103 ntTSL 1 (best)16.34■□□□□ 0.216e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 EIF4G1-208ENST00000413967 2808 ntTSL 219.05■□□□□ 0.642e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 EIF4G1-213ENST00000426123 2907 ntTSL 217.41■□□□□ 0.382e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 TJP2-203ENST00000377259 588 ntTSL 312.12□□□□□ -0.473e-12■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 SRCAP-202ENST00000395059 9126 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 KIAA0100-215ENST00000583403 1271 ntTSL 1 (best)27.74■■■□□ 2.039e-7■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 KIAA0100-205ENST00000577417 1839 ntTSL 1 (best)22.5■■□□□ 1.199e-7■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 KIAA0100-210ENST00000580882 1582 ntTSL 1 (best)17.32■□□□□ 0.369e-7■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 MSH6-208ENST00000493177 813 ntTSL 316.5■□□□□ 0.231e-9■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 TLN1-205ENST00000466916 446 ntTSL 212.74□□□□□ -0.372e-8■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 ZNF106-202ENST00000564754 1470 ntTSL 1 (best)18.2■□□□□ 0.55e-7■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 CAPRIN1-217ENST00000534825 668 ntTSL 322.49■■□□□ 1.193e-10■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.033e-10■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.863e-10■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 NUP188-201ENST00000372577 5689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.617e-7■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.351e-6■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.981e-6■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.661e-6■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.441e-7■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.351e-7■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.281e-7■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.261e-7■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.221e-7■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 EIF4G1-222ENST00000442406 5129 ntTSL 1 (best)15.39■□□□□ 0.051e-7■■■■□ 24.6
FMR1Q06787 IQGAP1-202ENST00000558003 596 ntTSL 38.5□□□□□ -1.053e-9■■■■□ 24.5
FMR1Q06787 KIAA0100-208ENST00000579924 477 ntTSL 35.46□□□□□ -1.549e-7■■■■□ 24.5
FMR1Q06787 LMNA-225ENST00000515824 393 ntTSL 224.02■■□□□ 1.441e-9■■■■□ 24.5
FMR1Q06787 SND1-206ENST00000468166 552 ntTSL 49.03□□□□□ -0.961e-7■■■■□ 24.5
FMR1Q06787 CHD4-214ENST00000545942 1317 ntTSL 1 (best)29.01■■■□□ 2.232e-8■■■■□ 24.5
FMR1Q06787 FERMT3-204ENST00000540957 588 ntTSL 525.87■■□□□ 1.739e-12■■■■□ 24.5
FMR1Q06787 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.153e-8■■■■□ 24.5
FMR1Q06787 ADK-204ENST00000478611 443 ntTSL 316.29■□□□□ 0.21e-8■■■■□ 24.5
FMR1Q06787 TMEM91-214ENST00000604123 757 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.123e-8■■■■□ 24.5
FMR1Q06787 AC011462.1-201ENST00000604424 567 ntTSL 413.89□□□□□ -0.193e-8■■■■□ 24.5
FMR1Q06787 TMEM91-204ENST00000413014 650 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.213e-8■■■■□ 24.5
FMR1Q06787 MAP3K7-205ENST00000369332 4830 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.48e-8■■■■□ 24.5
FMR1Q06787 MAP3K7-204ENST00000369329 4911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.448e-8■■■■□ 24.5
FMR1Q06787 MACF1-216ENST00000476350 5304 ntTSL 29.55□□□□□ -0.887e-9■■■■□ 24.5
FMR1Q06787 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.418e-8■■■■□ 24.5
FMR1Q06787 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.728e-8■■■■□ 24.5
FMR1Q06787 PPP2CA-201ENST00000231504 564 ntTSL 434.1■■■■□ 3.054e-6■■■■□ 24.4
FMR1Q06787 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.044e-6■■■■□ 24.4
FMR1Q06787 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.34e-6■■■■□ 24.4
FMR1Q06787 AC104109.4-201ENST00000520515 1744 ntTSL 29.12□□□□□ -0.954e-6■■■■□ 24.4
FMR1Q06787 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.094e-6■■■■□ 24.4
FMR1Q06787 PPP1R9B-201ENST00000513579 655 ntTSL 317.81■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 24.4
FMR1Q06787 PLEC-211ENST00000527303 598 ntTSL 328.06■■■□□ 2.088e-7■■■■□ 24.4
FMR1Q06787 NUP214-211ENST00000498010 483 ntTSL 516.34■□□□□ 0.213e-6■■■■□ 24.4
FMR1Q06787 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.168e-7■■■■□ 24.4
FMR1Q06787 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.211e-7■■■■□ 24.4
FMR1Q06787 MDN1-202ENST00000439638 3654 ntTSL 515.56■□□□□ 0.085e-7■■■■□ 24.4
FMR1Q06787 CTNNA1-216ENST00000519489 358 ntTSL 210.2□□□□□ -0.787e-7■■■■□ 24.3
FMR1Q06787 LINC01169-201ENST00000558797 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 24.3
FMR1Q06787 CDK5RAP2-205ENST00000425647 2747 ntTSL 210.95□□□□□ -0.661e-6■■■■□ 24.3
FMR1Q06787 CDK5RAP2-216ENST00000483412 6235 ntTSL 1 (best)10.11□□□□□ -0.791e-6■■■■□ 24.3
FMR1Q06787 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.733e-6■■■■□ 24.3
FMR1Q06787 CLUH-211ENST00000575014 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.49■□□□□ 0.717e-7■■■■□ 24.3
FMR1Q06787 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.557e-7■■■■□ 24.3
FMR1Q06787 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.337e-7■■■■□ 24.3
FMR1Q06787 CLUH-210ENST00000574426 3844 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.81■□□□□ 0.287e-7■■■■□ 24.3
FMR1Q06787 DARS2-201ENST00000361951 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.843e-6■■■■□ 24.3
FMR1Q06787 LTBP4-210ENST00000594448 573 ntTSL 518.35■□□□□ 0.533e-12■■■■□ 24.3
FMR1Q06787 LTBP4-215ENST00000596351 512 ntTSL 215.65■□□□□ 0.13e-12■■■■□ 24.3
FMR1Q06787 CAPN1-225ENST00000533704 643 ntTSL 313.26□□□□□ -0.292e-6■■■■□ 24.3
FMR1Q06787 CTNNA1-227ENST00000521387 871 ntTSL 210.6□□□□□ -0.714e-7■■■■□ 24.3
FMR1Q06787 INPPL1-209ENST00000540973 375 ntTSL 332.26■■■□□ 2.752e-6■■■■□ 24.2
FMR1Q06787 MAP1S-204ENST00000594212 1132 ntTSL 1 (best)27.7■■■□□ 2.022e-6■■■■□ 24.2
FMR1Q06787 INPPL1-214ENST00000543234 275 ntTSL 226.87■■□□□ 1.892e-6■■■■□ 24.2
FMR1Q06787 USP19-214ENST00000488993 1116 ntTSL 526.27■■□□□ 1.82e-6■■■■□ 24.2
FMR1Q06787 CCNDBP1-208ENST00000566515 1634 ntTSL 525.58■■□□□ 1.692e-6■■■■□ 24.2
FMR1Q06787 CCNDBP1-205ENST00000564630 2079 ntTSL 523.05■■□□□ 1.282e-6■■■■□ 24.2
FMR1Q06787 USP19-215ENST00000491859 919 ntTSL 323.02■■□□□ 1.282e-6■■■■□ 24.2
FMR1Q06787 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.162e-6■■■■□ 24.2
FMR1Q06787 USP19-210ENST00000465902 617 ntTSL 321.84■■□□□ 1.092e-6■■■■□ 24.2
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 56.3 ms